Detalhe da pesquisa
1.
A distinct Fusobacterium nucleatum clade dominates the colorectal cancer niche.
Nature
; 628(8007): 424-432, 2024 Apr.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38509359
2.
Effect of the intratumoral microbiota on spatial and cellular heterogeneity in cancer.
Nature
; 611(7937): 810-817, 2022 11.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36385528
3.
phippery: a software suite for PhIP-Seq data analysis.
Bioinformatics
; 39(10)2023 10 03.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37740324
4.
Metagenomic Analysis Reveals Clinical SARS-CoV-2 Infection and Bacterial or Viral Superinfection and Colonization.
Clin Chem
; 66(7): 966-972, 2020 07 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32379863
5.
Scalable single-cell profiling of chromatin modifications with sciCUT&Tag.
Nat Protoc
; 19(1): 83-112, 2024 Jan.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37935964
6.
Microbiome preterm birth DREAM challenge: Crowdsourcing machine learning approaches to advance preterm birth research.
Cell Rep Med
; 5(1): 101350, 2024 01 16.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38134931
7.
MaLiAmPi enables generalizable and taxonomy-independent microbiome features from technically diverse 16S-based microbiome studies.
Cell Rep Methods
; 3(11): 100639, 2023 Nov 20.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37939711
8.
INVADEseq to identify cell-adherent or invasive bacteria and the associated host transcriptome at single-cell-level resolution.
Nat Protoc
; 18(11): 3355-3389, 2023 Nov.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37789194
9.
Fusobacterium sphaericum sp. nov. , isolated from a human colon tumor, is prevalent in various human body sites and induces IL-8 secretion from colorectal cancer cells.
bioRxiv
; 2023 Jun 16.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37398369
10.
Optimizing metaproteomics database construction: lessons from a study of the vaginal microbiome.
mSystems
; 8(4): e0067822, 2023 08 31.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37350639
11.
Strain-level characterization of health-associated bacterial consortia that colonize the human gut during infancy.
medRxiv
; 2023 Dec 17.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38168439
12.
VMAP: Vaginal Microbiome Atlas During Pregnancy.
medRxiv
; 2023 Apr 05.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36993193
13.
Specific host metabolite and gut microbiome alterations are associated with bone loss during spaceflight.
Cell Rep
; 42(5): 112299, 2023 05 30.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37080202
14.
Microbiome Preterm Birth DREAM Challenge: Crowdsourcing Machine Learning Approaches to Advance Preterm Birth Research.
medRxiv
; 2023 Apr 11.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36945505
15.
The cancer chemotherapeutic 5-fluorouracil is a potent Fusobacterium nucleatum inhibitor and its activity is modified by intratumoral microbiota.
Cell Rep
; 41(7): 111625, 2022 11 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36384132
16.
Colonization of the live biotherapeutic product VE303 and modulation of the microbiota and metabolites in healthy volunteers.
Cell Host Microbe
; 30(4): 583-598.e8, 2022 04 13.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35421353
17.
geneshot: gene-level metagenomics identifies genome islands associated with immunotherapy response.
Genome Biol
; 22(1): 135, 2021 05 05.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33952321
18.
Strategies to Facilitate Translational Advances from Microbiome Surveys.
Trends Microbiol
; 28(5): 329-330, 2020 05.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32298611
19.
Human Tumor-Infiltrating MAIT Cells Display Hallmarks of Bacterial Antigen Recognition in Colorectal Cancer.
Cell Rep Med
; 1(3): 100039, 2020 06 23.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33205061
20.
De novo Assembly Vastly Expands the Known Microbial Universe.
Trends Microbiol
; 27(5): 385-386, 2019 05.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-30871856